Megawati tak mengkudeta Gus Dur. Fakta politiknya, Megawati Wakil Presiden Gus Dur (setelah Amien membuat manuver Poros Tengah, menyingkirkan kans Megawati, sebagai Ketua Umum partai pemenang Pemilu 1999), kandidat terkuat Presiden, yang waktu itu masih ditentukan MPR/DPR, belum dipilih langsung rakyat.